• Биохимия
• Физиология и биохимия микроорганизмов
• БАВ (Биологически активные вещества микроорганизмов)

• Почвенная энзимология. Составление биохимических почвенных картограмм антропогенных ландшафтов и агроценозов Республики Татарстан - РТ)
• Биохимия педосферы, антропогенных ландшафтов и палеопочв. Биота древних захоронений территории на территории РТ
• Молекулярная биология
• Биоинформатика
• Метагеномика
• Биотехнология с использованием нанотехнологий. (Биологическая защита растений на основе живых организмов и их метаболитов. Биоаугментация почв. Скрининг перспективных для биотехнологии микроорганизмов в педосфере. Разработка регламентов производства биопрепаратов на основе отходов пищевых предприятий Республики Татарстан и др.)
• Исследование распространенности рода Trichoderma в Поволжье.
• Систематика рода Trichoderma

Методы исследований: Методы практической и генетической микологии и микробиологии, методы энзимологии, молекулярно-генетический анализ, методы биохимического, микробиологического и генетического скрининга перспективных для биотехнологии антибиотиков микроорганизмов, атомно - силовая микроскопия (АСМ)и электронная

Количество опубликованных работ:

• Монографии - 4
• научные статьи - 70
• учебно-методические работы - 15
• изобретения и патенты - 4

1. Возможности получения экологически чистого корма для животноводства Республики Татарстан на фоне техногенного загрязнения агроландшафтов 2000-2001гг (ї04-4,5-83/2000-2002(ф)).
2. Разработка микробиологических методов снижения содержания токсинов в кормовых культурах культивируемых в РТ 2002гг (ї 04-4,4-195/2003(ф)).
3. "Экологически безопасные препараты - регуляторы роста микроорганизмов и растений. Санкт - Петербург. 2002-2003г.(їЕ02-6,0-140).
4. Издание книги "Trichoderma (Fungi, Ascomycetes, Hypocreales) таксономия и распространение 2004гг.( ї03-3.7-250 / 2004 (Ф)).
5. Микробиологический мониторинг заповедных и антропогенных ландшафтов РТ и определение эффективной, экологически безопасной нормы биопестицида для восстановления бедных, нарушенных почв.

• Штамм гриба Aspergillus fumigatus - продуцент целлюлазы (Авт. свид. N 1440920, 1986)
• Способ предпосевной обработки семян зерновых злаковых растений (Авт. свид. N1693745, 1989)
• Способ очистки почвы от нефтяных загрязнений. А №97102681/13.Опубликован20.06.2000 в RUABRU DB
• Способ обработки семян растений. -А.с. N1743018. -Опубл. в Б.И. -1992, N 6.
• А.с. №1440920. - Опубл. В БИШтамм гриба Trichoderma harzianum и способ его применения. № 2005114113/13(016203).

1. Алимова Ф.К. Микробная биотехнология. (Глава 5. Защита растений.) / Ф.К. Алимова, И.Б. Лещинская, Б.М. Куриненко, В.И. Вершинина, Т.В. Багаева, Л. И. Знаменская.- УНИПРЕСС:ДАС.: Казань, 2000. - 368 с.
2. Алимова Ф.К. Промышленное применение грибов рода Trichoderma/ Ф.К. Алимова.- Казань.: УНИПРЕСС ДАС, 2006. - 268 с.
3. Алимова Ф.К. Trichoderma/Hypocrea (Fungi, Ascomycetes, Hypocreales): таксономия и распространение/ Ф.К. Алимова.- Казань.: УНИПРЕСС ДАС, 2006. - 360 с.
4. Алимова Ф.К. Микробная биотехнология. МИздание третье, стереотипное/Под ред. О.Н.Ильинской / Ф.К. Алимова, И.Б. Лещинская, Б.М. Куриненко, В.И. Вершинина, Т.В. Багаева, и др.- Казань.: Казанский государственный университет им. В.И. Ульянова - Ленина, 2007. - 426 с.

1. Mako A.G., Alimova F.K.,Fattakhova A.N., Zakharova N.G.Optimization of antagonistic effect of Trichoderma harzianum (F - 432) using food waste //Sindh Univ. Res. Jour.(Sci.Ser). Vol 32(2): (2001).
2. Alimova F.K., AskarovaA.N., Fattachova A.N., Kiyamova S.N., Selivanovskaya S.Yu. Application of PCR for agriculture needs.// Fifeenth forum for applied biotechnology. 24-25 Sept. 2001 Proceedings part 2. Med.FacLndbouww.Univ.Gent.66/3b, 2001.
3. Alimova F.K., Zakharova N.G., Mako A.G., Fattachova A.N., Garusov A.V. The quarantin control and the methods of disinfection of tomato and cucumber seeds in different regions of Russian federation. // Pak.J. Sci Ind Res 2002 45(3).
4. Selivanovskaya S.Yu., 0Latypova V.Z., Kiyamova S.N., Alimova F.K. Use of microbial parameters to assess treatment methods of municipal sewage sludge applied to grey forest soils of Tatarstan// Agriculture, Ecosystems and Environment, 2001.-V.86,N2.
5. Селивановская С.Ю., Латыпова В.З., Киямова С.Н., Алимова Ф.К. Микробная биомасса и биологическая активность серых лесных почв при внесении осадков городских сточных вод// Почвоведение, 2001.-N2.
6. Тарасов Д.С., Акберова Н.И. , Тухбатова Р.М., Алимова Ф.К. Формат представления биологических описаний гриба и его применение на примере рода Trichoderma/Д.С. Тарасов, Р.И. //Вестник Татарстанского отделения российской экологической академии. - 2005 .- №2(24) C. 44-49
7. Алимова Ф.К. Современная система Trichoderma/Hypocrea (обзор). //Ученые записки Казанского университета. Сер.биол. - 2005.-Т. 147, кн.2 .Естественные науки. С.28 - 56.
8. Алимова Ф.К. Биопрепараты с разным механизмом действия для борьбы с грибными болезнями картофеля / Ф.К. Алимова, С.Н. Куликов, Н.Г. Захарова, С.В. Немцев, В.П. Варламов //Прикладная биохимия и микробиология, 2006, Т.42, № 1, с.86-92.
9. Д.С. Тарасов, Н.И. Акберова, Р.И. Тухбатова, Ф.К. Алимова Применение принципов объектно-ориентированного программирования к описанию и классификации биологических объектов на примере грибов рода Trichodermа/ //Ученые записки КГУ, серия естественные науки.- 2006. т. 148. кн. 3. с. 125-148.
10. Fakhrullin R.F. Living fungi cells encapsulated in polyelectrolyte shells doped with metal nanoparticlsе / R.F. Fakhrullin, A.Zamaleeva, M. Morozov, D.Tazetdinova, F.Alimova, A.Hilmutdinov, R.Zhdanov, M.Kahraman, M.Culha // Langmuir. - 2009, DOI: 10.1021/la803871lz.

1. С.Н. Куликов, Ф.К. Алимова, Н.Г. Захарова, С.В. Немцев, В.П. Варламов Препараты "АгроХит"R и "Триходермин" против болезней картофеля. Современные перспективы в исследовании хитина и хитозана. Материалы седьмой Международной конференции. Санкт - Петербург 15-18
2. Кучмина Е.Ю., Алимова Ф.К., Киямова С.Н., Иванченко О.Б., Селивановская С.Ю. Влияние Trichoderma harzianum на токсические и мутагенные свойства почвы" Тез докл. Всероссийской конференции "Сельскохозяйственная микробиология" в XIX-XXI веках", Санкт-Петербург, 2001 г., с.30-31.
3. Алимова Ф.К., Аскарова А.Н., Киямова С.Н., Кучмина Е.Ю Перспективы применения полимеразной цепной реакции в сельском хозяйстве в сельском хозяйстве. Современная техника и технология в медицине и биологии. Материалы международной научно-практической конференции.ч.2 Новочеркасск 2001.С.4
4. Selivanovskaya S.Yu., Latopova V.Z., Kiyamova S.N., Alimova F.K. Use of microbial parameters to assess treatment methos of municipal sewage sludge applied to grey forest soils of Tatarstan// Agriculture, Ecocyctems and Enviroment 86 (2001)145 -153. С.24-25.
5. Алимова Ф.К., Аскарова А.Н., Киямова С.Н., Габидуллина Л.Р. Генетическая изменчивость Trichoderma harzianum в почвах, контаминированных тяжелыми металлами.1 съезд микологов "Современная микология в России. М .2002г. С.161-162.
6. XX Congreso Nacional Microbiología Cáceres, España. 19 - 22 septiembre 2005 Ponencias y Comunicaciones "Universidad de Extremadura" Sociedad Española de Microbiología, Symposium of Biology Students in Europe" Finland 2005 University of Helsinki Department of Biology July 29^th to August 7^th 2005, Межд. Конф "Грибы и водоросли в биогеоценозах- Москва МГУ., 31янв. - 3 февраля 2006, 9^th International Workshop on Trichoderma and Gliocladium. Vienna, Austria, 5-8 Аpril 2006.

• Диплом призера II Республиканского конкурса "50 лучших инновационных идей Республики Татарстан" за лучшую инновационную идею "Биотехнология производства удобрений из осадков сточных вод".

Знание языков : Татарский (родной), русский, английский