В мае 2005г, в дни празднования 60-летия Победы, в музее открылась выставка, посвященная подвигу ученых московских и ленинградских институтов Академии наук СССР, эвакуированных в Казань в годы Великой Отечественной войны.

В июле 1941г было принято решение об эвакуации учреждений АН СССР из Москвы и Ленинграда. 19 июля в Казань вылетел вице-президент О.Ю.Шмидт, на которого было возложено руководство размещением академических учреждений, сотрудников и их семей. В музее хранятся командировочное удостоверение и авиабилеты О.Ю.Шмидта.

С 23 июля в Казань начали прибывать эшелоны с людьми и оборудованием. Город гостеприимно принял эвакуированных. Большую роль в их размещении сыграл А.Е.Арбузов, назначенный уполномоченным президиума по их устройству. Впоследствии академик А.Н.Несмеянов, возглавлявший Институт органической химии, вспоминал:

"Он встретил и наш эшелон, устроил на ночлег в здании университета, и мы сразу же почувствовали тепло и заботу. В считанные дни все были устроены с жильем, институты получили здания для размещения, закипела работа по их приспособлению. В центре всей этой кипучей деятельности стоял А.Е., всегда спокойный, благожелательный, распорядительный".

Центром академической жизни стал Казанский университет, который предоставил Академии свои аудитории, лаборатории, все подсобные и служебные помещения. Временно под общежития были оборудованы актовый и физкультурный залы. В музее, в его основной экспозиции, демонстрируется рисунок "Актовый зал в годы войны" - этот дружеский шарж был помещен в один из номеров стенгазеты Ленинградского физтеха.

Сейчас трудно представить зал университетского музея в военные годы: сто пятьдесят кроватей, отгороженных друг от друга простынями или картонками; проходов между ними нет, раздеваться или одеваться можно только пригнувшись или на корточках, в зале полумрак, несмолкающий гул голосов и шум примусов...