После смерти М.А.Ковальского, последовавшей в 1884г, профессором астрономии и геодезии и директором обсерватории стал Дмитрий Иванович Дубяго. Выпускник Петербургского университета, он в течение ряда лет работает в Пулковской обсерватории.

В 1878г за сочинение "Исследование орбиты спутника Нептуна по наблюдениям, произведенным Пулковским рефрактором с 1867 по 1876 годах" получает звание магистра, а в 1881г, - доктора астрономии и геодезии за работу "Теория движения Дианы". Период деятельности Д.И.Дубяго в Казани сыграл огромную роль в истории и развитии астрономической науки в Казанском университете.

Под его руководством были начаты наблюдения Луны, изучение ее физической либрации, осуществлялись систематические позиционные наблюдения малых планет, комет, двойных звезд и т.п. На основании наблюдений казанских астрономов, проведенных в 1869-1892гг Дубяго составил каталог 4281 звезды, исследовал орбиту спутника Нептуна, создал теорию движения малой планеты Дианы. С 1893г начато издание "Трудов Казанской городской астрономической обсерватории".

Самой большой заслугой Д.И.Дубяго является строительство в 1899-1901гг второй астрономической обсерватории в 20 км от города. Это стало возможным благодаря тесной дружбе Д.И.Дубяго с В.П.Эгельгардтом, доктором философии и астрономии, жившем в Дрездене, где у него была прекрасно оборудованная собственная обсерватория.

Еще при жизни, в 1897г, В.П.Энгельгардт передает Казанскому университету главнейшие инструменты и приборы своей обсерватории, 2000 томов своей библиотеки, а после смерти завещает ему все свое имущество, движимое и недвижимое. До конца дней своих Василий Павлович принимал горячее участие в строительстве новой обсерватории, которая получила название "Энгельгардтовская". Астрономическая обсерватория им.В.П.Эгельгардта стала одной из лучших в России, уступая лишь Пулковской, с 1908г "Известия астрономической обсерватории" расходятся по всему миру.