В научных исследованиях и учебном процессе сотрудники кафедры используют и живые растения. Сейчас на подоконниках кафедральных кабинетов можно обнаружить представителей разных семейств и географических зон.

Среди живых растений есть представители большинства отделов высших растений - моховидных, псилотовидных, папоротниковидных, голосеменных и покрытосеменных. Наиболее широко представлены покрытосеменные - самый многочисленный отдел высших растений. В коллекции есть однодольные растения, например, из семейств амариллисовых, ароидных, коммелиновых и других.

Большинство культивируемых растений относится к классу двудольных растений. Среди них выделяется коллекция представителей семейства кактусовых. В основе её лежат растения, выращенные из семян в самом начале 1970-х годов А.Г.Смирновым. С 1980 года пополнением и сохранением коллекции занимается А.П.Ситников.

Помимо кактусов и других суккулентов на кафедре выращиваются растения обладающие специфической жизненной формой или необычными морфологическими особенностями (иглица, монстера, банан, церопегия и многие другие).

Все предметы из коллекций кафедры ботаники и Ботанического музея активно используются в учебной работе. На практических занятиях студенты под руководством преподавателей кафедры ботаники создают современные коллекции, которые продолжат линию преемственности ботанических знаний в Казанском университете.